Las actividades del Instituto AMSUR están orientadas a la cooperación técnica e institucional en el desarrollo de alianzas con asociaciones y redes regionales, nacionales e internacionales, brindando consultoría y asistencia en la dirección de gobiernos de gran escala y organismos multilaterales de desarrollo y financiamiento. También monitorea la implementación y coordinación de las estructuras de gobierno, tales como: direcciones, órganos de alta dirección, sistemas de gobernanza, así como acciones de planificación estratégica - planes de metas, planes maestros, desarrollo urbano integral, entre otros.

Toda su actividad técnica no se limita a las más altas esferas del poder. El Instituto AMSUR incorpora en sus actividades de investigación y formación profesional el desarrollo de metodologías aplicadas a la eficiencia de la elaboración, ejecución y evaluación de políticas públicas con organizaciones de la sociedad civil, movimientos sociales, universidades, centros de investigación y consorcios públicos.